海参体壁含有很高的蛋白质含量，主要为胶原蛋白，达到76.5％。海参蛋白质中含有18种以上的氨基酸，而且比例较好，多为人体必须氨基酸。海参中精氨酸含量远远高于其他海产品,精氨酸是构成男性精细胞的重要成分,又是合成人体胶原蛋白的原料,并可促进细胞的再生和机体损伤后的修复,还可提高淋巴细胞的免疫活性,增强人体免疫力,延年益寿,这与祖国中医学“补益肾精”的理论不谋而合。海参蛋白以胶原蛋白为主体，其作用胜过与我国传统中药中补胶的阿胶、龟板胶与鹿角胶，该胶原蛋白中富含的甘氨酸和碱性氨基酸是生血、养血（血红素和珠蛋白的生物合成）和促进钙质吸收的物质基础。生物活性肽（bioactive peptide）是介于氨基酸与蛋白质之间的分子聚合物，它小至由两个氨基酸组成，大至由数百个氨基酸通过肽键连接而成，具有十分重要的生物学意义。现代生物代谢研究发现：人类摄取的蛋白质经过消化道的多种酶水解后，不像以前认为的那样仅以氨基酸的形式吸收，更多的是以低肽的形式直接吸收，而且二肽和三肽的吸收速度比相同组成的氨基酸快。其中某些低肽不仅能提供人体生长发育所需的营养物质，且同时具有重要的生理功能，如促进矿物质吸收肽、防治肝性脑病肽、易消化吸收肽、抗菌肽、吗啡片肽、类吗啡拮抗肽、血管紧张素转换酶抑制肽、抑制胆固醇作用肽、机体防御功能肽等。上述功能是原蛋白质或组成氨基酸所不具备的独特的生理机能，且许多活性肽的组成氨基酸并不一定是必需氨基酸。这就为更充分的利用蛋白质资源，特别是那些原本认为生物效价不高的蛋白质资源提供了新的机遇。研究表明，海参中含有的一种由亮、脯、丝、精氨酸构成的五肽具有明显的抗肿瘤和抗炎活性。海参体壁中含有多种活性多肽，从海参上皮组织分离获得的由亮、脯、丝、精等氨基酸构成的五肽（其中个别氨基酸为D-型），相对分子质量568.1，具有抗肿瘤和抗炎活性，该五肽的人工合成品也取得了相一致的效果。近年来,多肽越来越受到重视,现代生物学实验已经证明,多肽与蛋白质和氨基酸相比具有更突出的生理活性:多肽在肠道中的吸收率最好,一些低肽如二肽、三肽的吸收速度比单一的氨基酸快;多肽具有低抗原、促进脂质代谢、降低胆固醇、促进矿物质吸收、降血压、抗氧化等生理功能;一些多肽具有强化机体免疫、促进人体新陈代谢的作用;多肽具有较好的酸、热稳定性、水溶性,而且粘度随浓度变化不明显。